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图形用户界面 
一个基于微软Windows图形用户界面(GUI)管理的运行HYDRUS的输出需求，以及网格设计和编辑、参数配置、问题执行和结果可视化。HYDRUS还包括一组控件，允许用户创建一个流和运移模型，并对运行中的图形进行分析。使用空间和横截面查看和线图来检查输入和输出。HYDRUS图形用户界面的主程序单元定义了系统整体的计算环境。这个主模块控制程序的执行并确定哪些其他可选的工具是必要的。该模块还包含一个项目管理器和两个预处理和后处理单元。预处理单元包括所有必要的参数规格,如成功运行HYDRUS FORTRAN语言代码、相对简单的矩形和六面体传输域的网格生成器、用于非结构化有限元网格的复杂二维和三维域的网格生成器、一个小目录的土壤水力属性和从土壤结构数据的Rosetta Lite程序生成土壤水力属性。 

自动生成有限元网格 
数据预处理涉及二维流动区域规范，具有任意形状连续的折线、圆弧、样条函数、域边界的离散化和一个非结构化的有限元网格的下一个版本。HYDRUS（标准版）带有一个可选的网格生成程序，Meshgen可以生成一个非结构化有限元网格的二维域。HYDRUS基于Delaunay推论，已经被无缝集成到HYDRUS环境里了。在没有Meshgen程序的情况下，HYDRUS GUI提供了一个简单、结构化网格的自动构建选项(Lite版本)。三维版本是在Lite和Standar本下添加了的相同或不同厚度的层数。HYDRUS 3D版有一个三维网格生成程序(GENEX和T3D)，为通用三维域生成非结构化有限元网格。 

后处理 
输出图形包括水含量、流速、浓度、温度在空间或横断面视图的2D等高线（等值线或彩色光谱）。图形输出还包括速度矢量图、彩色边缘、颜色的点、连续的时间步的图形显示和动画以及选定的边界或内部截面线图。用户可以将感兴趣的区域缩放，横截面视图的垂直刻度也可以放大。网格还可以展示边界和编号的三角形、边缘和点。观察点可以添加到网格的任何地方。网格和/或空间分布结果(压力头、水含量、速度、浓度和温度)的视图都使用高分辨率彩色或灰阶值。界面还包括一个内容丰富的在线帮助菜单。 

域和有限元网格区域 
为了简化复杂的运移几何图形的工作，这些图形可以划分为简单的部分称为Section. 只有这些简单的部分可以在视图窗口中显示,而剩下的部分被隐藏。一共有两种类型的Section:基于几何对象的和基于有限元网格的。可以同时显示多个section。使用各种命令可以切断和隐藏不需要的运移区域部分。 

Column infiltration test
Water flow and solute Transport in a field soil profile under grass - seasonal simulation
Two-dimension unidirectional solute transport - comparison with analytical solution
One-dimensional solute transport with nitrification chain - comparison with analytical solution
One-dimensional solute transport with nonlinear cation adsorption - Data from Selim et al. (1987)
One-dimensional solute transport with non-equilibrium cation adsorption
Axisymetrical three-dimensional water and solute infiltration test
One-dimensional water flow with multiple hysteretic loops, data from Lenhard et al. (1991)
Water flow and solute transport from furrow to a drain
Three wetland examples

New Features and Changes (related to GUI):
1. Flowing particles in 3D projects
2. Streamlines
3. Graphical Manipulator

At present, HYDRUS considers up to fifteen solutes, which can either be coupled in a unidirectional chain or move independently of each other. Physical nonequilibrium solute transport can be accounted for by assuming a two-region, dual porosity type formulation, which partitions the liquid phase into mobile and immobile regions. Attachment/detachment theory, including the filtration theory, is included to simulate transport of viruses, colloids, and/or bacteria.
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